洛阳地区种嗜尸性丽蝇和基因序列分析(2) - 洛阳师范学院学报杂志社投稿

来稿应自觉遵守国家有关著作权法律法规，不得侵犯他人版权或其他权利，如果出现问题作者文责自负，而且本刊将依法追究侵权行为给本刊造成的损失责任。本刊对录用稿有修改、删节权。经本刊通知进行修改的稿件或被采用的稿件，作者必须保证本刊的独立发表权。一、投稿方式： 1、请从我刊官网直接投稿。 2、请从我编辑部编辑的推广链接进入我刊投审稿系统进行投稿。二、稿件著作权： 1、投稿人保证其向我刊所投之作品是其本人或与他人合作创作之成果，或对所投作品拥有合法的著作权，无第三人对其作品提出可成立之权利主张。 2、投稿人保证向我刊所投之稿件，尚未在任何媒体上发表。 3、投稿人保证其作品不含有违反宪法、法律及损害社会公共利益之内容。 4、投稿人向我刊所投之作品不得同时向第三方投送，即不允许一稿多投。 5、投稿人授予我刊享有作品专有使用权的方式包括但不限于：通过网络向公众传播、复制、摘编、表演、播放、展览、发行、摄制电影、电视、录像制品、录制录音制品、制作数字化制品、改编、翻译、注释、编辑，以及出版、许可其他媒体、网站及单位转载、摘编、播放、录制、翻译、注释、编辑、改编、摄制。 6、第5条所述之网络是指通过我刊官网。 7、投稿人委托我刊声明，未经我方许可，任何网站、媒体、组织不得转载、摘编其作品。

洛阳地区种嗜尸性丽蝇和基因序列分析(2)

作者:

关键词:

摘要：

表2 丽蝇科23个样本COⅠ基因序列在线BLAST比对结果注：1）本研究提交序列GenBank注册号；2）BLAST比对序列GenBank登录号编号属种 0 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 GenBank注册号1）MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF MF绿蝇属绿蝇属绿蝇属金蝇属金蝇属金蝇属绿蝇属绿蝇属叉丽蝇属叉丽蝇属丽蝇属丽蝇属丽蝇属阿丽蝇属阿丽蝇属阿丽蝇属绿蝇属绿蝇属绿蝇属绿蝇属绿蝇属绿蝇属绿蝇属丝光绿蝇丝光绿蝇丝光绿蝇大头金蝇大头金蝇大头金蝇铜绿蝇铜绿蝇叉丽蝇叉丽蝇反吐丽蝇反吐丽蝇反吐丽蝇巨尾阿丽蝇巨尾阿丽蝇巨尾阿丽蝇叉叶绿蝇亮绿蝇亮绿蝇亮绿蝇紫绿蝇紫绿蝇紫绿蝇BLAST比对结果Lucilia sericataLucilia sericataLucilia sericataChrysomya megacephalaChrysomya megacephalaChrysomya megacephalaLucilia cuprinaLucilia cuprinaTriceratopyga calliphoroides Triceratopyga calliphoroides Calliphora vomitoriaCalliphora vomitoriaCalliphora vomitoriaAldrichina grahamiAldrichina grahamiAldrichina grahamiLucilia caesarLucilia illustrisLucilia illustrisLucilia illustrisLucilia porphyrinaLucilia porphyrinaLucilia porphyrinaGenBank登录号2）KY.1 KY.1 KY.1 KR.1 KR.1 KR.1 MF0.1 KP.1 KP.1 KP.1 KM.1 KM.1 KM.1 KM.1 KX0.1覆盖率/相似度100%/100%100%/100%100%/99%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/99%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/99%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/100%100%/99%100%/99%

2.3 系统发育树分析

以家蝇（28SrRNA的GenBank登录号为KC.1，COⅠ的GenBank登录号为KF.1）为外群，GenBank中叉叶绿蝇的28S rRNA和COⅠ序列各两条纳入一并分析，运用MEGA 7.0软件对25个样本的基因序列进行分析，构建系统发育树，结果按照不同属、种分别聚类，分子鉴定结果和形态学鉴定结果一致（图1），效果较好。

28S rRNA基因序列构建的系统发育树显示：按照不同属种分别聚类，共5属9种，自上而下3只亮绿蝇、3只叉叶绿蝇、3只紫绿蝇、2只铜绿蝇、3只丝光绿蝇、2只叉丽蝇、3只巨尾阿丽蝇、3只反吐丽蝇、3只大头金蝇分别聚类，Bootstrap检验可信度分别为64%、93%、85%、97%、99%、64%、65%、64%和99%，绿蝇属的Bootstrap检验可信度为93%。

COⅠ基因序列构建的系统发育树显示：按照不同属种分别聚类，共5属9种，自上而下3只叉叶绿蝇、3只亮绿蝇、3只紫绿蝇、2只铜绿蝇、3只丝光绿蝇、3只巨尾阿丽蝇、2只叉丽蝇、3只反吐丽蝇、3只大头金蝇分别聚类，Bootstrap检验可信度分别为100%、98%、100%、85%、95%、100%、100%、100%和100%，绿蝇属的Bootstrap检验可信度为82%。

2.4 种内及种间进化分歧

经计算本研究中丽蝇科5属9种蝇类28S rRNA和COⅠ基因的遗传距离发现：不同蝇种28S rRNA基因序列种内差异为0，叉丽蝇、反吐丽蝇和巨尾阿丽蝇，叉叶绿蝇和亮绿蝇的种间差异均为0.001，叉丽蝇和反吐丽蝇，叉叶绿蝇和紫绿蝇的种间差异均为0.003，亮绿蝇和紫绿蝇的种间差异为0.004，丝光绿蝇和铜绿蝇的种间差异为0.008，其余种间差异为0.014～0.033；COⅠ基因序列种内差异为0～0.008，丝光绿蝇和铜绿蝇的种间差异为0.006～0.009，叉叶绿蝇和亮绿蝇的种间差异为0.011/0.013，其余种间差异为0.037～0.101。详见表3～4。

图1 基于25个样本28S rRNA和COⅠ基因序列构建的系统发育树A：基于28S rRNA基因序列；B：基于COⅠ基因序列；右侧依次显示为蝇种名称、GenBank登录号；左侧分支上的数字表示群聚的Bootstrap检验可信度（%）；图左下方为标尺，表示0.0100进化距离的长度

表3 25个样本28S rRNA基因序列的种间差异和种内差异蝇类大头金蝇丝光绿蝇铜绿蝇叉丽蝇反吐丽蝇巨尾阿丽蝇叉叶绿蝇亮绿蝇紫绿蝇大头金蝇0 0.033 0.033 0.023 0.023 0.021 0.024 0.026 0.026丝光绿蝇铜绿蝇叉丽蝇反吐丽蝇巨尾阿丽蝇叉叶绿蝇亮绿蝇紫绿蝇0 0.008 0.029 0.032 0.030 0.018 0.020 0.020 0 0.026 0.029 0.027 0.018 0.020 0.020 0 0.003 0.001 0.016 0.017 0.018 0 0.001 0.016 0.017 0.018 0 0.014 0.016 0.017 0 0.001 0.003 0 0.0040

表4 25个样本COⅠ基因序列的种间差异和种内差异注：“/”表示或丝光绿蝇铜绿蝇叉丽蝇反吐丽蝇蝇类大头金蝇丝光绿蝇铜绿蝇叉丽蝇反吐丽蝇巨尾阿丽蝇叉叶绿蝇亮绿蝇紫绿蝇大头金蝇0 0.090/0.092 0.092/0.094 0.098 0.088/0.089 0.093 0.086 0.088/0.086 0.094～0.101巨尾阿丽蝇叉叶绿蝇亮绿蝇紫绿蝇0.054/0.056 0.079 0.077 0.078/0.079 0.090/0.092 0/0.002 0.006～0.009 0.083/0.085 0.063～0.067 0.074/0.076 0.048/0.049 0.048～0.051 0.053～0.060 0 0/0.002 0.061/0.063 0.058/0.060 0.063～0.067 0.076～0.080 0.002 0.089/0.090 0.069～0.072 0.076/0.078 0.046/0.048 0.048～0.051 0.055～0.062 0 0 0.003～0.008 0.075 0.084/0.086 0.086～0.088 0.011/0.013 0.037～0.041 0/0.002 0.044～0.049

文章来源：《洛阳师范学院学报》网址: http://www.lysfxyxb.cn/qikandaodu/2021/0323/540.html