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洛阳地区种嗜尸性丽蝇和基因序列分析(3)
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摘要:3 讨 论 法医昆虫学中与PMI关系最为密切的是双翅目蝇类,主要包括以丽蝇科为代表的17科,有数百种嗜尸性蝇类[3],而利用嗜尸性蝇类推断PMI的首要任务就
3 讨 论
法医昆虫学中与PMI关系最为密切的是双翅目蝇类,主要包括以丽蝇科为代表的17科,有数百种嗜尸性蝇类[3],而利用嗜尸性蝇类推断PMI的首要任务就是鉴定其种类。作为尸体上发育最早的昆虫,丽蝇科蝇种为实际案例应用中涉及最多的昆虫种类,常为推断PMI提供依据,是法医昆虫学中最有意义的种类。河南省地处中原,位于暖温带与亚热带,有记录的嗜尸性丽蝇多达14种之多[4]。鉴于案发现场提取的蝇类样本的多样性和复杂性,对于非昆虫专业人员很难从形态学鉴定其种属,尤其对苍蝇幼虫、蛹、卵生长发育规律的把握和形态学的鉴定,更是难上加难。自SPERLING等[5-6]将以DNA为基础的方法用于嗜尸性昆虫种类鉴定后,作为形态学鉴定方法的补充手段,DNA分子鉴定被越来越多的法医昆虫学研究者所接受。
线粒体COⅠ基因在动物学领域被作为种属遗传标记建立方法[7]后,因其具有拷贝数高、易分离、高保守性结构等特点,已被应用于法医昆虫学领域。而其中的DNA条形码区域序列测定被证实有益于各地双翅目的种属分子鉴定[8-12]。核基因28S rRNA具有重要的生物学功能,是真核生物染色体上编码核糖体大亚基的基因,在进化上比较保守,是研究生物系统发育较好的分子标记[13]。有学者提出,为提高种属鉴定的准确性,开发更多的遗传标记是一种可以选择的策略[12,14]。相较于线粒体COⅠ基因,嗜尸性蝇类28S rRNA基因研究较少。
本研究中9种23只丽蝇,基于28S rRNA和COⅠ基因序列的分子鉴定结果均与形态学鉴定分类结果一致。COⅠ序列种内差异为0~0.008,丝光绿蝇和铜绿蝇的种间差异为0.006~0.009,叉叶绿蝇和亮绿蝇的种间差异为0.011/0.013,其余种间差异为0.037~0.101。WELLS等[15]对丽蝇科mtDNA进行了测序及系统发育分析,发现COⅠ+COⅡ种间差异≥3%,而种内差异<1%,由此根据COⅠ+COⅡ基因序列差异来判断丽蝇个体是否同种。按照此理论分析,本研究中COⅠ基因序列不能有效区分丝光绿蝇和铜绿蝇,叉叶绿蝇和亮绿蝇,而在其他蝇种之间均可有效区分。28S rRNA基因序列分析发现,叉丽蝇、反吐丽蝇和巨尾阿丽蝇,叉叶绿蝇和亮绿蝇的种间差异均为0.001,叉丽蝇和反吐丽蝇,叉叶绿蝇和紫绿蝇的种间差异均为0.003,亮绿蝇和紫绿蝇的种间差异为0.004,丝光绿蝇和铜绿蝇的种间差异为0.008,其余种间差异为0.014~0.033,其中只有大头金蝇和丝光绿蝇、铜绿蝇,丝光绿蝇和反吐丽蝇、巨尾阿丽蝇的种间差异≥3%,同理只可有效区分这些蝇种。
与COⅠ基因序列相比,28S rRNA基因序列种内、种间差异均较小,提示此现象与该基因序列本身关系较为密切。根据FRéZAL等[16]的理论,用来界定物种种内、种间差异的值并非是一个定值,而应该根据实际情况加以修正。本研究中采用的28S rRNA基因序列种内、种间差异值的确定需要进一步研究和验证。值得注意的是,在COⅠ基因序列种间差异整体明显大于28S rRNA基因序列的情况下,丝光绿蝇和铜绿蝇的种间差异却与28S rRNA基因序列非常接近,因此推测对于区分近缘关系的丝光绿蝇和铜绿蝇,28S rRNA基因序列鉴定效力可能优于COⅠ基因序列,这有待于更多样本的验证。BLAST在线比对过程中没有发现一致的叉丽蝇、巨尾阿丽蝇和紫绿蝇的28S rRNA基因序列,说明该蝇种的相关研究较少,而本研究可以为此提供基础数据。
WELLS等[15]认为,分子鉴定即使不能够准确确定某一特定嗜尸性蝇种,至少可以把未知蝇种定位于某一特定的进化分支上。本研究中部分蝇种即使不能根据种内、种间差异来确定和区分,但所有样本均位于某一特定的分支上,Bootstrap检验可信度较高,并且两种分子标记系统发育分类一致,起到了很好的验证和补充作用。
综上所述,联合28S rRNA和COⅠ基因序列片段可以较好地区分本研究中的9种嗜尸性丽蝇,但对于近缘种丝光绿蝇和铜绿蝇,叉叶绿蝇和亮绿蝇的判定需要更多遗传标记的开发和联合应用。
[1]AMENDT J,KRETTEK R,ZEHNER entomology[J].Naturwissenschaften,2004,91(2):51-65.
[2] 赵琳琳,翟仙敦,张振,等.基于28S rRNA基因序列对洛阳地区嗜尸性蝇类的分子鉴定[J].法医学杂志,2018,34(2):114-119.
[3] 刘钦来.嗜尸性丽蝇分子标记的检测及发育规律的研究[D].长沙:中南大学,2013.
[4] 蒿自睿,王江峰,万香波,等.我国嗜尸性蝇类分布的相关文献综述[J].寄生虫与医学昆虫学报,2006,13(4):251-256.
[5]SPERLING F A,ANDERSON G S,HICKEY D A.A DNA-based approach to the identification of insect species used for postmortem interval estimation[J].J Forensic Sci,1994,39(2):418-427.
文章来源:《洛阳师范学院学报》 网址: http://www.lysfxyxb.cn/qikandaodu/2021/0323/540.html
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